《Rewrite》绿化都市，风祭居住在这个提倡以文明与绿色共存为理想的都市里的天王寺瑚太朗，和神户小鸟，吉野晴彦等朋友们一起过着平凡的日子。在这和平的风祭市，即将迎来一年一度的热闹时期——全城瞩目的收获季。在这大型的文化祭般的活动中，瑚太朗开始打工了，内容是收集报刊文章材料。因为在风祭流传着未确认生物的情报，以及超自然的现象之类的似真非真的传闻。同时，在瑚太朗身上开始发生一些不可思议的事情。瑚太朗向超自然研究会的部长，千里朱音的求助，于是展开了涉及到瑚太朗认识的学生们的调查。对于瑚太朗来说，原本只是抱着一点冒险心态而已。只要能和热闹的伙伴们一起度过的话，这样就足够了。但瑚太朗还没有注意到，他将要探求那无人知晓的『真实』。